Cyanobacteria memiliki struktur sel yang khas dan berbeda dari organisme fotosintetik lainnya. Meskipun sering disamakan dengan alga, struktur cyanobacteria lebih menyerupai bakteri karena merupakan organisme prokariotik.

Struktur Sel Prokariotik

Cyanobacteria tidak memiliki inti sel sejati maupun organel bermembran seperti kloroplas dan mitokondria. Namun, mereka memiliki membran tilakoid di mana proses fotosintesis berlangsung. Dinding sel cyanobacteria biasanya tersusun dari peptidoglikan, layaknya bakteri lain.

Bentuk Koloni dan Filamen

Cyanobacteria dapat ditemukan dalam bentuk sel tunggal, berkoloni, maupun membentuk filamen panjang. Beberapa spesies membentuk struktur khusus seperti heterosista untuk fiksasi nitrogen.

Pigmen Fotosintetik

Selain klorofil-a, cyanobacteria juga mengandung pigmen fikosianin dan fikobilin yang memberikan warna biru-hijau. Keberadaan pigmen-pigmen ini membantu mereka beradaptasi dengan berbagai kondisi cahaya di habitatnya.