Biologi komputasi
Biologi komputasi adalah bidang interdisipliner yang memanfaatkan informatika, matematika, dan statistika untuk memahami sistem biologi secara kuantitatif dan komputasional. Disiplin ini menggabungkan pemodelan teoretis, analisis data skala besar, serta simulasi komputer untuk mempelajari fenomena biologis mulai dari tingkat molekul hingga ekosistem. Pendekatan dalam biologi komputasi digunakan secara luas dalam genomika, proteomika, biologi sistem, serta bioinformatika, dan telah menjadi pendorong utama kemajuan penelitian biomedis modern.
1. Dasar Teori dan Metodologi
- Bioinformatika
- Biologi sistem
- Matematika komputasi
- Statistika biologi
- Pemodelan komputasi
- Simulasi komputer
- Algoritme genetika
- Machine learning dalam biologi
- Pemrosesan sinyal biologis
2. Genomika dan Analisis DNA
- Genomika komputasi
- Analisis urutan DNA
- Perakitan genom
- Penjajaran urutan
- Identifikasi gen
- Genom perbandingan
- Epigenomika
- Analisis varian genetik
3. Proteomika dan Analisis Protein
- Proteomika komputasi
- Prediksi struktur protein
- Pemodelan homologi
- Docking molekuler
- Interaksi protein-protein
- Jaringan protein
- Analisis domain protein
4. Biologi Sistem dan Jaringan
- Jaringan metabolik
- Jaringan regulasi gen
- Pemodelan dinamika populasi sel
- Dinamika sistem nonlinier
- Analisis jalur sinyal
- Teori graf dalam biologi
- Pemodelan sistem kompleks
5. Simulasi dan Pemodelan Molekuler
- Dinamika molekuler
- Simulasi Monte Carlo
- Pemodelan kuantum kimia
- Interaksi biomolekul
- Pemodelan membran sel
- Pemodelan ligand-reseptor
- Simulasi sel tunggal
6. Analisis Data Biomedis
- Analisis citra biomedis
- Pengolahan data mikroskop
- Pengolahan data sekuensing
- Data mining biologi
- Big data dalam biomedis
- Integrasi data multi-omik
7. Aplikasi Klinis
- Pengenalan pola dalam diagnosis
- Prediksi penyakit
- Farmakogenomika
- Desain obat berbasis komputasi
- Medisin presisi
- Bioinformatika klinis
- Analisis biomarker