Rantai makanan laut dalam memiliki struktur yang berbeda dengan rantai makanan di permukaan laut. Terbatasnya sumber energi dan nutrisi menyebabkan interaksi antarorganisme sangat efisien dan unik. Setiap tingkat trofik di laut dalam berperan penting dalam menjaga keseimbangan ekosistem.
Produsen Primer
Di laut dalam, produsen primer bukanlah fitoplankton yang melakukan fotosintesis, melainkan bakteri kemosintetik yang hidup di sekitar ventilasi hidrotermal atau seeps dingin. Mereka mengubah senyawa anorganik menjadi energi yang kemudian dimanfaatkan oleh organisme lain.
Konsumen dan Predator
Konsumen di laut dalam meliputi berbagai jenis zooplankton, krustasea, dan ikan yang memakan detritus atau organisme lain. Predator tertinggi, seperti ikan naga dan cumi-cumi raksasa, memangsa hewan-hewan yang lebih kecil.
Pengurai dan Daur Ulang Nutrisi
Kelompok pengurai, seperti bakteri dan jamur, memecah sisa-sisa organisme mati sehingga nutrisi dapat didaur ulang dan dimanfaatkan kembali oleh produsen primer di ekosistem laut dalam.