Struktur pepsin telah menjadi fokus utama dalam studi biokimia enzim. Pepsin merupakan protein globular dengan struktur kompleks yang memungkinkan interaksi spesifik dengan substratnya. Penelitian tentang struktur pepsin memberikan wawasan tentang mekanisme kerja enzim protease secara umum.

Komposisi Rantai Polipeptida

Pepsin terdiri dari rantai polipeptida tunggal yang tersusun atas lebih dari 300 residu asam amino. Struktur tiga dimensi pepsin membentuk kantung aktif yang dapat mengikat protein substrat dengan presisi tinggi.

Situs Aktif dan Mekanisme Katalitik

Situs aktif pepsin mengandung residu aspartat yang sangat penting untuk aktivitas katalitiknya. Residue ini berperan dalam mengaktifkan molekul air untuk menyerang ikatan peptida pada substrat protein, menghasilkan reaksi hidrolisis.

Studi Struktur dengan Kristalografi

Struktur pepsin telah dipecahkan menggunakan kristalografi sinar-X. Informasi ini sangat berguna dalam memahami bagaimana pepsin dan protease lain bekerja, serta dalam pengembangan obat-obatan yang dapat menghambat aktivitas enzim ini pada kondisi medis tertentu.