Genom prokariotik memiliki organisasi gen yang khas dan efisien, memungkinkan ekspresi gen yang cepat dalam menanggapi perubahan lingkungan. Organisasi ini berbeda secara signifikan dari genom eukariotik.

Operon

Salah satu ciri utama organisasi gen di prokariotik adalah keberadaan operon, yaitu kelompok gen yang dikendalikan oleh satu promotor dan diekspresikan bersama-sama. Contoh terkenal adalah operon lac pada Escherichia coli.

Gen Struktural dan Regulasi

Gen dalam genom prokariotik biasanya terdiri dari gen struktural (mengkode protein) dan gen regulator (mengatur ekspresi gen). Gen regulator seperti represor dan aktivator memainkan peran penting dalam mengatur ekspresi operon.

Efisiensi Ekspresi Gen

Organisasi gen yang efisien ini memungkinkan prokariotik untuk dengan cepat mengadaptasi metabolisme dan perilaku mereka sesuai dengan kondisi lingkungan, berbeda dengan regulasi gen pada eukariotik yang lebih kompleks.