Bioinformatika
Bioinformatika adalah bidang interdisipliner yang menggabungkan biologi, ilmu komputer, matematika, dan statistik untuk menganalisis, menginterpretasikan, serta memvisualisasikan data biologis dalam skala besar. Bidang ini berkembang pesat seiring dengan kemajuan teknologi genomik dan sequencing DNA berkapasitas tinggi, yang menghasilkan data kompleks seperti genom, transkriptom, dan proteom. Bioinformatika memainkan peran penting dalam penelitian biomedis, penemuan obat, diagnosis penyakit, serta pengembangan bioteknologi modern.
1. Konsep Dasar Bioinformatika
- Genomik
- Proteomik
- Metabolomik
- Transkriptomik
- Biologi sistem
- Analisis sekuens
- Pemodelan molekuler
- Analisis filogenetik
- Standar data biologis
- Ontologi biologi
2. Teknologi dan Metode
- Pengurutan DNA
- Pengurutan RNA
- Pengurutan generasi berikutnya
- Microarray
- PCR digital
- Metode alignment sekuens
- Analisis motif DNA
- Pemodelan struktur protein
- Prediksi gen
- Simulasi dinamika molekul
3. Algoritma dan Pemrograman
- Algoritma Needleman–Wunsch
- Algoritma Smith–Waterman
- BLAST
- FASTA
- Hidden Markov model
- Machine learning
- Pembelajaran mendalam
- Pemrograman bioinformatika
- Analisis big data
- Pengolahan paralel
4. Basis Data dan Sumber Daya
5. Analisis Data Biologis
- Normalisasi data
- Analisis diferensial ekspresi
- Klasifikasi biologis
- Clustering
- Analisis jalur metabolik
- Analisis jaringan biomolekul
- Analisis integratif multi-omik
- Analisis evolusi
- Analisis populasi genom
- Analisis varian genetik
6. Aplikasi Bioinformatika
- Penemuan obat
- Diagnostik molekuler
- Pertanian genomik
- Bioteknologi industri
- Forensik genetik
- Konservasi biodiversitas
- Pengembangan vaksin
- Medisin presisi
- Analisis resistensi antibiotik
- Studi penyakit langka