Lihat sumber Autotrof dan Siklus Biogeokimia

Autotrof berperan penting dalam [[siklus biogeokimia]] di alam, khususnya dalam siklus karbon, nitrogen, dan sulfur. Tanpa autotrof, siklus-siklus ini tidak akan berjalan dengan baik sehingga mengganggu keseimbangan ekosistem.

== Siklus Karbon ==
Dalam [[siklus karbon]], autotrof mengikat karbon dioksida dari atmosfer melalui proses fotosintesis. Karbon yang terikat menjadi dasar penyediaan energi dan materi organik.

== Siklus Nitrogen ==
Beberapa autotrof, seperti [[bakteri nitrifikasi]], berperan dalam mengubah nitrogen anorganik menjadi senyawa yang dapat digunakan oleh tumbuhan lain.

== Siklus Sulfur ==
Kemoautotrof tertentu memanfaatkan senyawa sulfur anorganik dalam proses metabolisme mereka, sehingga turut mengatur keseimbangan sulfur di lingkungan.