Lihat sumber Faktor Internal yang Mempengaruhi Perkecambahan

Perkecambahan benih tidak hanya dipengaruhi faktor eksternal, tetapi juga sangat dipengaruhi oleh faktor internal dari biji itu sendiri. Faktor-faktor ini berperan dalam menentukan apakah biji akan mampu berkecambah dengan baik atau tidak.

== Daya Dormansi Biji ==
Dormansi adalah keadaan ketika biji tidak langsung berkecambah meskipun lingkungan sudah mendukung. Dormansi dapat disebabkan oleh faktor internal seperti kulit biji yang keras, adanya senyawa penghambat, atau embrio yang belum matang.

== Cadangan Makanan dalam Biji ==
Cadangan makanan yang cukup dalam biji sangat penting untuk menunjang awal pertumbuhan embrio. Cadangan ini umumnya berupa [[amilum]], [[lemak]], atau [[protein]] yang akan dipecah dan digunakan saat perkecambahan berlangsung.

== Kesehatan dan Vitalitas Biji ==
Biji yang sehat dan vital memiliki kemampuan perkecambahan yang lebih tinggi. Biji yang sudah tua atau terinfeksi patogen, seperti [[jamur]] atau [[bakteri]], cenderung gagal berkecambah atau menghasilkan tanaman yang lemah.