Lihat sumber Tantangan dan Kendala dalam Pertanian Organik

Meskipun memiliki banyak manfaat, pertanian organik juga menghadapi berbagai tantangan dan kendala. Tantangan tersebut meliputi aspek teknis, ekonomi, hingga sosial budaya yang memengaruhi adopsi sistem pertanian organik oleh petani.

== Produktivitas dan Hasil Panen ==
Salah satu kendala utama adalah produktivitas yang seringkali lebih rendah dibandingkan pertanian konvensional, terutama pada masa transisi. Petani juga menghadapi risiko gagal panen karena belum terbiasa dengan teknik budidaya organik.

== Ketersediaan Benih dan Input Organik ==
Ketersediaan [[benih organik]], pupuk alami, dan pestisida nabati masih menjadi masalah di beberapa daerah. Hal ini membuat biaya produksi menjadi lebih tinggi dan menyulitkan petani kecil untuk beralih ke sistem organik.

== Pemasaran dan Edukasi Konsumen ==
Kurangnya edukasi mengenai keunggulan produk organik menyebabkan permintaan pasar masih terbatas. Selain itu, sistem pemasaran produk organik belum terintegrasi dengan baik sehingga petani kesulitan mendapatkan harga yang layak.