Lihat sumber Pengaruh Zooplankton terhadap Kualitas Air

Keberadaan zooplankton dalam perairan sangat berpengaruh terhadap kualitas air. Mereka berperan dalam mengendalikan populasi fitoplankton dan membantu menjaga kejernihan serta kandungan oksigen di air.

== Pengendalian Fitoplankton ==
Zooplankton memakan [[fitoplankton]], sehingga membantu menekan pertumbuhan alga yang berlebihan. Jika populasi fitoplankton tidak terkendali, dapat terjadi [[bloom alga]] yang menyebabkan penurunan kualitas air.

== Peran dalam Daur Nutrisi ==
Melalui proses makan dan ekskresi, zooplankton membantu mendaur ulang [[nutrisi]] seperti nitrogen dan fosfor di perairan. Nutrisi ini kemudian dapat dimanfaatkan kembali oleh fitoplankton.

== Indikator Kesehatan Ekosistem ==
Komposisi dan jumlah zooplankton dapat menjadi indikator kesehatan [[ekosistem akuatik]]. Penurunan atau ledakan populasi zooplankton bisa menandakan adanya gangguan ekosistem, seperti polusi atau eutrofikasi.